公积金贷款的扣款是有扣款时间的，所以扣款前你只需要将除每月公积金金额以外的剩余部分存入还款账户即可。有两种方式可供选择：1。可以一次性偿还卡内公积金金额，然后重新计算每月还款额，继续按月还贷(每个月赶还款金额)。比如公积金卡里的金额一开始就不要动。存了一定金额后，贷款要一次性还完，然后按照每月还款额先冲资金再扣款。2.每月注销还款。(简单来说就是每月剩余公积金金额的还款金额)比如公积金贷款用完后，每月需要还款3000元，但是公积金每月的充值金额是1000元。首先，卡里在第一个月还贷的时候，必须充值3000元，然后每个月只需要在扣款日之前冲进2000元。